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https://www.antec-bio.com.tw/custom_97034.html 技術介紹技術介紹 KAPA Adapter KitsKAPA Dual-Index Adapter Kit■ 經 functionally tested 確保優異的文庫構建效率及較少的 adapter-dimer 形成■ barcode cross-contamination 通過 Sequencing-based QC 檢測■ 可應用於 KAPA HyperPrep、KAPA HyperPlus、KAPA RNA HyperPrep 和 HyperCap workflowKAPA Unique Dual-Indexed Adapter Kit■ Non-redundant dual sequencing barcode 組合 (unique dual indexing) 可降低 index 錯誤配置■ 經 functionally tested 確保優異的文庫構建效率及較少的 adapter-dimer 形成■ 可應用於 KAPA HyperPrep、KAPA HyperPlus、KAPA RNA HyperPrep 和 HyperCap workflowKAPA HyperPure BeadsKAPA HyperPure Beads 為 KAPA NGS DNA workflows 提供優異的核酸回收率，以及靈活可調整且一致的片段篩選大小。■ 進化版磁珠，提高清洗效率，進而提升文庫多樣性降低定序成本■ 快速、有效的去除實驗反應不需要的成分 (例如：adapters、adapter-dimers、primers、primer-dimers、nucleotides、salts 和 enzymes)■ 可調節片段篩選大小KAPA HiFi DNA PolymeraseKAPA HiFi DNA polymerase 是使用定位進化技術 (directed evolution technology) 所產生一超高正確率及穩定性酵素。由於具有高產率、高正確率及低錯誤率 (low amplification bias) 等特點，目前於次世代定序 (nest-generation sequencing) 實驗中指定使用於增殖 DNA。可使定序結果具有較低的重覆性 (low duplication rates) 的且改善在 GC 及 AT rich 區域及其他不易增殖區域的覆蓋率。■ Sanger Institute 次世代 (NGS) 指定使用■ 最高的正確率，Taq polymerase 的 100X■ 可以擴增各種複雜模板，AT- and GC-rich targets■ 長度高達 15 KB■ 具備 HotStart 與 ReadyMix 版本KAPA HiFi Uracil+ DNA Polymerase 對於被亞硫酸氫鹽 (Bisulfite) 處理的 DNA，將未甲基化的胞嘧啶 (C) 轉變成尿嘧啶 (U)，在 DNA 序列中，具有較多尿嘧啶。KAPA HiFi Uracil+ DNA Polymerase 主要由 KAPA HiFi DNA Polymerase 改造產生可針對尿嘧啶序列為模版及低濃度 AT rich DNA 進行 PCR 增殖反應。傳統高效能的 DNA polymerase 並無法適用於此類的 DNA 模版。KAPA HiFi Uracil+ DNA Polymerase 在針對此類 DNA 仍保有高產率、低錯誤率且有均勻的覆蓋率。■ 在具有尿嘧啶序列中，仍具有高產率及低錯誤率特性■ 在 bisulfite-sequencing 中具有高均一度的覆蓋率■ 改善 bisulfite-sequencing 讀取正確性

https://www.antec-bio.com.tw/custom_97025.html 技術介紹技術介紹 KAPA RNA Hyper Kits 系列單管設計，利用嶄新的技術，減少構築 RNA library 步驟，只需一天 (包含 RNA enrichment)，即可完成高品質的 RNA library 構築■ One-tube 流程縮短實際操作時間■ 從 input RNA 開始約 4 小時可完成 library 構築■ 保持超過 99％的 strand 特異性■ 針對 low-input 與 degraded 樣品有較高的成功率■ 搭配自動化機器可獲得高通量與一致性的結果KAPA mRNA Hyper Prep KitsKAPA mRNA Hyper Prep kits 主要用於針對含 poly A 的 mRNA，可針對 10-400 ng RNA 進行建庫，可針對 mRNA 進行建庫針對蛋白轉錄區域定序。■ mRNA capture 只需約 1.5 小時■ 減少 rRNA 定序的浪費，及降低 PCR 重覆率■ 相較於一般 RNA-seq，在等量的定序結果中可得到更多專一的基因KAPA RNA Hyper with RiboErase本試劑組中，以 DNA probe 雜合後利用 RNase H 去除樣品內 rRNA，使樣品中轉錄子 (transcripts) 及其他重要的訊息序列，如 precursor mRNAs、noncoding RNAs 等含量增加。同時在試劑組中採用 KAPA HiFi DNA polymerase 能更精準擴增目標序列，使定序更具完整度。■ 可移除高達 99.98% 的 rRNA 包含 cytoplasmic (5S, 5.8S, 18S, and 28S) 與 mitochondrial (12S and 16S)■ 樣本用量彈性 100 ng – 1 μg■ 適用於 human、mouse 或 rat species■ 可用於FFPE sample

https://www.antec-bio.com.tw/custom_97026.html 產品資訊產品資訊產品資訊 KAPA HyperPlus KitsKAPA HyperPrep Kits KAPA RNA HyperPrep KitKAPA mRNA HyperPrep KitKAPA RNA HyperPrep Kit with RiboErase (HMR)KAPA RNA HyperPrep Kit with RiboErase (HMR) GlobinKAPA HiFi HotStart Library Amplification KitKAPA HiFi HotStart Library Amplification Kit with Primer MixKAPA Library Amplification Primer Mix Kit KAPA Library Quantification Kit (Universal)KAPA Library Quantification Kit (ABI Prism)KAPA Library Quantification Kit (Bio-Rad)KAPA Library Quantification Kit (optimized for Roche® LightCycler 480)KAPA Library Quantification Kit (ROX Low)Internal ControlDNA Standards (1-6) onlyKAPA HyperPure Beads KAPA UDI AdaptersCatalog (Pre-designed and off the shelf)Custom (user-defined)Shared Design (Pre-designed)HyperCap Target Enrichment KitHyperCap Bead KitNimbleDesign Software

https://www.antec-bio.com.tw/custom_96967.html 技術介紹技術介紹 Target enrichment 有效在建庫時捕捉感興趣的 targeted gene，減少 reads 數浪費，提高經濟效益。使用 KAPA HyperCap Workflow v3.2，可搭配 KAPA HyperExome Probes、KAPA HyperChoice 及 HyperExplore Probes 客製化符合實驗需求的探針提供一整套完整且高效率的建庫流程。Roche KAPA HyperCap workflow (Hybridization-Based Target Enrichment) 除原有的 human exome panel，現在新推出兩種 panel 分別可使用於"癌症基因檢測"及"遺傳疾病基因檢測"。Roche Hybridization-Based Target Enrichment 流程將 Genomic DNA 進行片段化 (fragmentation) 接上 adapter，利用 biotinylated oligonucleotide probes 和目標基因 (e.g. exome) 進行雜交作用 (hybridization)，再利用 streptavidin beads 結合 biotin 間接抓下目標基因，爾後進行 washing, elution. amplification步驟，最終進行上機定序，藉此流程針對感興趣基因序列進行分析。 KAPA HyperExome Probes 全外顯子體定序 (whole exome sequencing, WES)，相對 WGS 可提高深度及降低花費，已廣泛運用於癌症基因、遺傳性疾病、罕見疾病、預防醫學等相關的基因檢測。KAPA HyperExome Probes 利用 HG38 human genome 進行設計，capture target 僅有 ~43 Mb 仍在 RefSeq, CCDS, Ensembl, GENCODE 及 ClinVar 資料庫皆有良好涵蓋率，且不同資料庫分析結果相似度高。KAPA HyperCap Fixed Panels此系列包含了 KAPA HyperCap Oncology Panel 與 KAPA HyperCap Heredity PanelKAPA HyperCap Oncology Panel 癌症基因檢測■ 探針捕獲區域 214 Kb 覆蓋13 個 somatic oncology 高度相關基因■ 在commercial FFPET 和 cfDNA controls 中額外涵蓋 hotspot varients■ 10 ng cfDNA 定序50M HQ clusters，即有大於97.5% 的目標區域達到1000X 深度的定序覆蓋率KAPA HyperCap Heredity Panel 遺傳疾病基因檢測 ■ 涵蓋 3,332 個和遺傳疾病高度相關的基因■ 探針捕獲區域小於 10Mb■ 最大化經濟效益，定序 10M HQ clusters，即有大於 98% 的目標區域達到 30X 深度的定序覆蓋率■ ACMG 73、ClinVar、ENSEMBL 及 RefSeq 多個醫學資料庫皆有 85~99% 高覆蓋度Customized Panel：KAPA HyperChoice and HyperExplore Probes提供 hyperdesign (https://hyperdesign.com/) 網站，針對感興趣基因設計客製化 probe，捕捉及擴增目標序列 (Target Enrichment)。KAPA HyperChoice (human genome probe) 及 KAPA HyperExplore Probes (non-human genome probe) 皆可設計捕捉高達 200 Mb 的目標基因，高均勻度地抓取目標片段。KAPA HyperCap Workflow v3.2

技術介紹

Target enrichment 有效在建庫時捕捉感興趣的 targeted gene，減少 reads 數浪費，提高經濟效益。使用 KAPA HyperCap Workflow v3.2，可搭配 KAPA HyperExome Probes、KAPA HyperChoice 及 HyperExplore Probes 客製化符合實驗需求的探針提供一整套完整且高效率的建庫流程。

Roche KAPA HyperCap workflow (Hybridization-Based Target Enrichment) 除原有的 human exome panel，現在新推出兩種 panel 分別可使用於"癌症基因檢測"及"遺傳疾病基因檢測"。

Roche Hybridization-Based Target Enrichment 流程
將 Genomic DNA 進行片段化 (fragmentation) 接上 adapter，利用 biotinylated oligonucleotide probes 和目標基因 (e.g. exome) 進行雜交作用 (hybridization)，再利用 streptavidin beads 結合 biotin 間接抓下目標基因，爾後進行 washing, elution. amplification步驟，最終進行上機定序，藉此流程針對感興趣基因序列進行分析。

KAPA HyperExome Probes
全外顯子體定序 (whole exome sequencing, WES)，相對 WGS 可提高深度及降低花費，已廣泛運用於癌症基因、遺傳性疾病、罕見疾病、預防醫學等相關的基因檢測。
KAPA HyperExome Probes 利用 HG38 human genome 進行設計，capture target 僅有 ~43 Mb 仍在 RefSeq, CCDS, Ensembl, GENCODE 及 ClinVar 資料庫皆有良好涵蓋率，且不同資料庫分析結果相似度高。

KAPA HyperCap Fixed Panels
此系列包含了 KAPA HyperCap Oncology Panel 與 KAPA HyperCap Heredity Panel

KAPA HyperCap Oncology Panel 癌症基因檢測
■ 探針捕獲區域 214 Kb 覆蓋13 個 somatic oncology 高度相關基因
■ 在commercial FFPET 和 cfDNA controls 中額外涵蓋 hotspot varients
■ 10 ng cfDNA 定序50M HQ clusters，即有大於97.5% 的目標區域達到1000X 深度的定序覆蓋率

KAPA HyperCap Heredity Panel 遺傳疾病基因檢測
■ 涵蓋 3,332 個和遺傳疾病高度相關的基因
■ 探針捕獲區域小於 10Mb
■ 最大化經濟效益，定序 10M HQ clusters，即有大於 98% 的目標區域達到 30X 深度的定序覆蓋率
■ ACMG 73、ClinVar、ENSEMBL 及 RefSeq 多個醫學資料庫皆有 85~99% 高覆蓋度

Customized Panel：KAPA HyperChoice and HyperExplore Probes
提供 hyperdesign (https://hyperdesign.com/) 網站，針對感興趣基因設計客製化 probe，捕捉及擴增目標序列 (Target Enrichment)。
KAPA HyperChoice (human genome probe) 及 KAPA HyperExplore Probes (non-human genome probe) 皆可設計捕捉高達 200 Mb 的目標基因，高均勻度地抓取目標片段。

KAPA HyperCap Workflow v3.2