Sequencing by expansion (SBX)
2025年羅氏(Roche)發表了新的DNA定序方法:Sequencing by expansion (SBX),能以更快速且準確的方式完成定序。
這是一種新型的高通量單分子測序技術。SBX 技術提供了多功能且可擴展的定序方案,特別適用於基因組研究,能夠在分子層面上提供更精確的基因組學資訊。這項技術在大規模測序項目中具備顯著的準確性和效率優勢,有望推動基因組學領域的發展。
有別於目前短片段定序的螢光測序方式(利用配對的鹼基結合發出的不同螢光進行鹼基定序),SBX是採用奈米孔(nanopore)的方式利用不同(鹼基)分子有不同的阻抗特性,當DNA通過孔洞,藉由測量阻抗來判別序列。Oxford Nanopore Technologies也利用同樣方式進行定序。
但SBX更進一步,一邊擴張一邊定序,利用nanopore定序增加定序速度,結合了“expansion” 的技術來增加的定序的準確性。與其直接量測鹼基,不如讓序列和另一種比較大的分子Xpandomer進行配對,形成一個由Xpandomer組成的互補序列,再利用nanopore量測Xpandomer的序列。每一個Xpandomer分子間的距離是鹼基間距離的50倍長。這個方式可以增加nanopore定序的準確程度。
有關此技術的相關資料, 可參考以下網頁
https://sequencing.roche.com/us/en/videos/webinar-sequencing-by-expansion-technology.html