Roche KAPA HyperPETE~羅氏全新精益求精的 Target Enrichment 系統
■ 結合 Hybrid capture 效能和 Amplicon based 效率
■ 一天完成建庫+目標基因擴增
■ 高均一度及覆蓋率
■ 可偵測 SNVs、 short indels、CNVs、MSI 及 fusion transcripts
■ 適用於 cfDNA、FFPE 及 RNA 等珍貴及微量樣本
■ 可搭配羅氏二、三級分析軟體 NAVIFY Mutation Caller & NAVIFY Mutation Profiler 輸出 Clinical report 快速且精準解釋突變點位
KAPA HyperPETE 原理
KAPA HyperPETE (Primer Extension Target Enrichment) 為羅氏獨家技術,建庫完成後利用兩段 primer (Capture primer & Release primer) 有效捕獲"目標基因片段"再進行 library 放大。結合 Hybrid capture 效能和 Amplicon based 效率,縮短實驗時間同時達成高覆蓋均一度結果 (*僅需約八小時即可完成建庫及目標序列擴增)。
KAPA HyperPETE 優異的均一度
與 Amplicon-based 不同的地方是 KAPA HyperPETE 並非直接使用 primer 擴增目標序列,因此可以減少PCR-bias 並有效地提高覆蓋均一度。
KAPA HyperPETE 高精準度與高覆蓋度
■ On-target rate 可達 65% ~ 73%
■ 1000X 深度無論是 10ng 或 50ng 皆有近 100% 覆蓋度
■ 3000X 深度可達約 80-85% 覆蓋度 (50ng)
KAPA HyperPETE 有效偵測變異位點
使用 10 ng and 50 ng 微量 RNA input amounts,仍能利用 KAPA HyperPETE LC Fusion Panel 及 NAVIFY® Mutation Caller 有效辨認 RNA fusion。
Roche 新推出五個臨床疾病 panel 與 KAPA hyperPETE 搭配使用,以下為臨床疾病 panel size 及應用領域
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